Урок 3 из 4 · Урок 36. I've lost my keys: случилось, и это видно сейчас

Не и вопрос: have сам выходит вперёд

Have — помощник, поэтому do ему не нужен. Not цепляется прямо за have, а в вопросе have выходит вперёд — так же, как am / is / are в уроке 1:

I, you, we, they he, she, it
Не I haven't finished. She hasn't called.
Вопрос Have you finished? Has she called?
Коротко Yes, I have. / No, I haven't. Yes, she has. / No, she hasn't.

В «Ты не видел мой телефон?» русское «не» стоит из вежливости. В английском его нет: Have you seen my phone? С not вопрос звучал бы как упрёк.

Ловушка — позвать do по старой привычке: «Do you have finished?», «Did you have seen…?». Помощник уже есть — have. Два помощника подряд не ставят.